Hepatotoxicity를 유도하는 thioacetamid의 in vivo와 in vitro 간에 발현 profiling 비교

Abstract

Microarray 기술은 단일 hybridization에서 매우 광대하게 유전자의 발현을 profiling 할 수 있다. 그리고 Microarray 기술은 독성과 관련하여 생물학적 system을 위한 강력한 분자유전적 기술로서 사용되어지고 있다. 우리가 중점을 두고 있는 부분은 rat 간과 cell line(WB-F344)에서 hepatotoxicity와 관련이 있는 유전자 발현의 결정을 위해서 독성학의 사용이다. Thioacetamide는 hepatotoxic 화합물이며, 간 대사에 영향을 주며, mRNA 운송을 저해하고 면역 억제를 유발한다. 우리는 DNA microarray를 사용하여 thioacetamide에 의해서 in vivo와 in vitro에서 특이적으로 발현되는 유전자를 profiling 했다. 5-6주된 남성 rat(Sprague-Dawely VAF + albino) 3마리와 WB-F344 cell line에 24시간 동안 thioaceta,id(500mg/kg and 5mM and 10mM)을 처리하였다. 전체 RNA는 thioacetamide가 처리되어진 rat의 간에서 추출하였고, cDNA microarray 기술을 사용하기 위해서 형광물질과 합성하였다. 직접 만든 4.8k cDNA microarray는 유전자 발현을 profiling하는데 사용되어졌다. 게다가 in vitro에서는 in vivo에서 관찰되어진 유전자 발현과 유사한 성향을 가지고 있음을 보여주었다.;Microarray technology, which is massive parallel gene expression profiling in a single hybridization experiment, has provided as a powerful molecular genetic tool for biological system related toxicant. Here we focus on the use of toxicogenomics for the determination of gene expression analysis associated with hepatotoxicity in rat liver and cell line(WB-F344). Thioacetamide is a hepatotoxic compound that affects liver metabolism, inhibits mRNA transport and induceds immune suppression. We carried out DNA microarray analyses to assess thioacetamide-specific expression profiles in vivo and in vitro. Male sprague-Dawely VAF+ albino 3rats of 5-6 weeks old and WB-F344 cell line were treated with a dose(500mg/kg and 5mM and 10mM) of thioacetamide for 24th. Total RNA isolated from rat liver that treated thioacetamide was used to synthesis of fluorescence for cDNA microarray. 4.8K cDNA microarray in house has been used for gene expression profiling. Furthermore, in vitro systems appeard similar in their ability to reproduce thioacetamide- induced changes in gene expression observed in vivo.