단백질로 발현되는 5'-UTR 펩타이드의 발굴과 분석

Abstract

프로테오믹스 연구에서 단백질의 서열을 밝히는 것은 중요한 일이다. 이미 알려진 단백질이라고 하더라도 서열의 변화는 기능적인 변화를 가져올 수 있다. 본 논문에서는 이미 알려진 단백질에서 tUTR(translational Untranslated Region)를 찾기 위한 연구에 대해 서술한다. 본 논문에서 관심의 대상이 되는 tUTR은 알려진 TIS(Translation Initiation Site)의 upstream에 존재하는 새로운 TIS(uTIS)와 mRNA가 단백질로 발현되는 것으로 알려진 CDS(Coding Sequence) 부분 사이에 존재하며 이 영역을 5’-UTR이라 부른다. 일반적인 프로테오믹스에서는 단백질 동정을 위해서 질량 스펙트럼과 표준 서열 데이터베이스를 사용한다. 그러나 단백질로 번역이 되지 않는 것으로 알려진 5’-UTR 부분은 표준 서열에 포함되지 않으므로 tUTR 영역에 해당하는 RNA 서열로부터 번역해 만든 새로운 데이터베이스를 이용해서 단백질 동정을 하여 tUTR 펩타이드를 발굴하였다.