본 논문은 금융기관의 기업지배구조와 기업가치 간의 관계를 일반 제조업의 경우와 비교하여 분석하고 있다. 실증분석결과에 따르면 제조업 기업의 경우 지배구조의 개선은 기업가치의 유의한 증가를 가져오나 금융기관의 경우 그 개선 정도가 제조업에 비해 통계적으로 유의하게 적은 것으로 나타난다. 이는 금융기관의 사업적 특성으로 인해 주주와 경영진 간의 이해상충문제가 일반기업에 비해 보다 심각할 수 있음에도 불구하고 외부감독기관 등에 의한 경영감시기능으로 인해 이러한 문제가 완화되고 있으며, 외부감독기능이 내부 경영감시장치를 어느 정도 보완함으로써 금융기관 내부지배구조의 차이가 이들의 가치에는 별다른 영향을 미치지 않는 것으로 해석된다.