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데이터 마이닝을 활용한 단백질의 아세틸화와 위암의 관계성 분석

Title
데이터 마이닝을 활용한 단백질의 아세틸화와 위암의 관계성 분석
Other Titles
Data mining approach to analyze the relation between protein acetylation and gastric cancer
Author
박혜원
Alternative Author(s)
Park, Hye Won
Advisor(s)
백은옥
Issue Date
2017-08
Publisher
한양대학교
Degree
Master
Abstract
단백질 아세틸화 반응이 암과 밀접하게 관련이 있다는 연구가 활발히 진행되고 있는 가운데, 본 논문에서는 바이오인포매틱스(Bioinformatics)와 데이타 마이닝(Data mining)을 활용하여 그 관계성을 입증하고자 한다. 분석 파이프라인은 크게 4단계로 구성되어 있다. 첫 번째는 단백질 데이터의 MS/MS 분석과 데이터 전처리 과정을 통한 데이터 선별단계. 두 번째는 데이터베이스 검색 알고리즘을 활용한 펩타이드 식별 단계. 세 번째는 식별된 PSM을 FDR 을 추정하고, 펩타이드들의 유니크함을 판별하는 단계. 네 번째는 필터링 된 펩타이드들의 실험적 정량값을 추출 및 클러스터링 기법을 적용하여 유사한 특성들이 지니는 분포를 확인하고 클러스터링 결과에서 각 클러스터들이 가지고 있는 유전자 및 단백질의 기능적 특성을 도출하는 단계로 이루어져 있다. 이와 같은 분석을 통하여 질병과 관련이 있다고 추정되는 특정 단백질을 찾는 것이 가능해졌고, 넓은 의미에서는 질병의 치료 목적에도 영향이 있음을 의미한다.
URI
http://hdl.handle.net/20.500.11754/33682http://hanyang.dcollection.net/common/orgView/200000431274
Appears in Collections:
GRADUATE SCHOOL[S](대학원) > COMPUTER SCIENCE(컴퓨터·소프트웨어학과) > Theses (Ph.D.)
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