공유 펩티드를 이용한 단백질 정량

Abstract

프로테오믹스는 단백질의 기능을 분석하고, 성질을 파악하는 학문분야이다. 단백질의 기능과 성질에 따라 질병이 나타날 수 있기 때문에 프로테오믹스 관련 연구를 통하여 질병의 원인을 밝혀낼 수 있다. 질병의 원인을 밝히기 위한 방법으로 질병 세포에만 나타나는 단백질을 조사할 수 있다. 연구 방법 가운데 한 가지로 단백질 정량 분석이 있는데, 세포가 포함하고 있는 단백질의 양을 분석하는 과정이다. 정상 세포와 질병 세포의 단백질 정량 분석을 통해 한쪽에서만 나타나는 단백질을 분석할 수 있고, 이는 질병의 원인이 되는 단백질일 가능성이 높다. 단백질의 정량을 위해서는 펩티드 정량이 사전에 이루어져야 한다. 그렇기 때문에 펩티드 정량의 정확성이 곧 단백질 정량의 정확성으로 이어진다. 펩티드 정량을 위해서는 하나의 단백질에서 나오는 고유 펩티드와 두 개 이상의 단백질에서 나오는 공유 펩티드로 나누어야 한다. 기존에는 신뢰도 문제 때문에 고유 펩티드만을 단백질 정량에 이용해 왔다. 기존의 방법은 단백질 정량에 사용될 수 있는 펩티드 정보를 일부분만 사용할 수밖에 없었고, 최악의 경우 특정 단백질에 대한 정량이 불가능했다. 본 논문에서는 RNA-Seq 정량 정보를 사용하여 고유 펩티드의 양을 늘리는 방법을 제시하고 기존 방법과 비교 분석한다.